Il modulo Magazzino presenta molteplici funzionalità indispensabili ad una gestione razionale ed efficiente delle merci in deposito. Con il Magazzino è possibile effettuare tutte le operazioni necessarie ad una corretta movimentazione della merci. Nella gestione anagrafiche articoli possono essere inseriti, codificati gli articoli di vendita e acquisto e possono essere gestiti dati necessari al riordino come ad esempio il livello di scorta minima, è inoltre possibile associare all'articolo un'immagine in diversi formati. (bmp, jpg, tiff, png e altro).

Abbinando ad esempio una fotografia a ogni articolo per stamparla nei listini e nelle schede prodotto. Con MosaicoX è possibile disporre della suddivisione articoli per Categorie merceologica e Tipo Articolo gestendo produttori, marca prodotti e sottogruppi di prodotti, al fine di effettuare statistiche mirate e ricercare i prodotti più velocemente nelle anagrafiche. Con MosaicoX è possibile effettuare la gestione dei codici a barre; nel caso in cui degli articoli fossero sprovvisti di codice a barre, c'è la possibilità di creare una etichetta riportante il codice a barre attribuito nell'anagrafica articoli. Nel caso l'oggetto abbia invece un codice a barre preventivamente associato dal produttore, possiamo utilizzare tale codice associandolo all'articolo.

E' possibile scaricare/caricare i prodotti con un'unica operazione tramite l'utilizzo di semplici lettori barcode oppure, per una gestione più avanzata, tramite l'utilizzo di lettori batch. In MosaicoX ogni singolo articolo può essere movimentato con Unità di Misura diverse selezionando di volta in volta quella più appropriata sulla riga di ogni documento. In MosaicoX è possibile gestire più Depositi e disporre in ogni momento oltre al valore globale di magazzino, anche le quantità disponibili sui diversi depositi e tramite documento è possibile anche spostare della merce tra più depositi. Il programma permette inoltre la gestione di quantità e valori di magazzino sia a livello fiscale che di singolo deposito, la valorizzazione può essere effettuata al prezzo di un listino (sia di acquisto che di vendita). La funzione include la gestione lotti (registrazione dei lotti di appartenenza e delle date di scadenza per ogni articolo movimentato) e dei seriali (Supporto per la registrazione del numero di serie di ogni articolo movimentato).